نحوه استفاده از حلقه ساقه: تجزیه و تحلیل موضوعات داغ و محتوای داغ در کل شبکه در 10 روز گذشته
به تازگی ، محبوبیت ساختار حلقه ساقه در زمینه های زیست شناسی مولکولی و مهندسی ژنتیک همچنان رو به افزایش است ، به ویژه در استفاده از فناوری CRISPR و تحقیقات و توسعه واکسن RNA باعث بحث گسترده شده است. در این مقاله مباحث محبوب در سراسر شبکه طی 10 روز گذشته برای تجزیه و تحلیل کاربردها ، نکات فنی و آخرین پیشرفت تحقیقات حلقه های STEM قرار دارد.
1. مفاهیم اساسی ساختار ساقه و حلقه
حلقه های ساقه ساختارهای ثانویه است که توسط مولکول های اسید نوکلئیک تک رشته ای (DNA یا RNA) از طریق جفت شدن پایه تشکیل می شوند ، از جملهساقه(منطقه دوتایی) وقسمت حلقه(منطقه تک رشته ای بدون زوج). توابع آن متنوع است و شامل تنظیم بیان ژن ، نگهداری پایداری RNA و غیره است.
قسمتهای ساختاری | ویژگی های عملکردی | سناریوهای کاربردی |
---|---|---|
ساقه | جفت شدن مکمل پایه پایداری ساختاری را فراهم می کند | طراحی RNA CRISPR |
قسمت حلقه | منطقه انعطاف پذیر ، درگیر در شناخت مولکولی | miRNA الزام آور هدفمند |
2. موارد برنامه های محبوب در 10 روز گذشته
1بهینه سازی واکسن RNA(محبوبیت ★★★★★ ☆)
آخرین تحقیقات Moderna نشان می دهد که با تنظیم ساختار حلقه ساقه 5 انتهای واکسن mRNA ، راندمان بیان پروتئین می تواند 40 ٪ بهبود یابد.
2ارتقاء ابزار ویرایش ژن(محبوبیت ★★★★★★★★ ک)
سیستم "CRISPR-SL" که توسط موسسه تحقیقاتی گسترده ساخته شده است از ساختار حلقه ساقه برای دستیابی به موفقیت در ویرایش دقت استفاده می کند:
شاخص های فنی | CRISPR سنتی | نسخه بهینه سازی حلقه ساقه |
---|---|---|
میزان خارج از هدف | 15-25 ٪ | 3 ٪ |
کارایی ویرایش | 70-80 ٪ | 92-95 ٪ |
3. راهنمای عملیات تجربی
نقاط طراحی:
• طول ساقه: 4-8bp توصیه می شود
• اندازه حلقه: معمولاً 4-10NT
• محتوای GC: با 40-60 ٪ کنترل می شود
مقایسه ابزارهای مشترک:
نام نرم افزاری | مزایا | سناریوهای قابل اجرا |
---|---|---|
رنفلد | ابزارهای آنلاین رایگان | ساختار ثانویه را به سرعت پیش بینی کنید |
نوپا | تجزیه و تحلیل تعامل چند مولکولی | طراحی سیستم پیچیده |
4. روندهای مرزی صنعت
1. تیم دانشگاه شانگهای جیاوتونگ انواع جدیدی را کشف کردسوئیچ حلقه ساقه پاسخ دهنده عکس، می تواند زمان و تهویه مطبوع بیان ژن را تحقق بخشد (طبیعت بیوتکنولوژی ، 2023)
2. آخرین راهنمای FDA ایالات متحده تأکید می کند که ساختار حلقه ساقه داروهای RNA باید مورد استفاده قرار گیردویژگی های کیفیت کلیدی(CQA) برای توصیف
5. اغلب س questions الات
س: آیا ساختار حلقه ساقه بر راندمان تقویت PCR تأثیر می گذارد؟
پاسخ: بله. توصیه می شود از منطقه اتصال پرایمر جلوگیری شود یا از آنزیم TAQ با شروع گرم استفاده کنید.
س: چگونه می توان ساختار حلقه ساقه طراحی شده را تأیید کرد؟
پاسخ: روش سه مرحله ای توصیه شده: ① پیش بینی نرم افزار ② آزمایش تحرک الکتروفورز (EMSA) ③ آزمایش محافظت از آنزیم
پایان
با توسعه زیست شناسی مصنوعی ، ساختار حلقه ساقه به ابزاری اصلی در طراحی اجزای ژن تبدیل شده است. تسلط بر اصول طراحی خود و آخرین روندهای فنی به محققان علمی کمک می کند تا در ژن درمانی ، زیست شناسی مصنوعی و سایر زمینه ها پیشرفت کنند.
جزئیات را بررسی کنید
جزئیات را بررسی کنید